В кишечной микрофлоре половины населения Земли нашли новый вирус

Биологи из Университета Сан-Диего объявили об обнаружении ранее неизвестного вируса-бактериофага, поражающего один из самых распространенных типов кишечных бактерий. Ученые полагают, что вновь открытый вирус присутствует в кишечнике у более чем половины населения Земли и может играть важную роль в развитии ожирения и диабета.
В кишечной микрофлоре половины населения Земли [нашли новый вирус]
Бактериофаг атакует бактерию. Иллюстрация с сайта phages.org /
2 минуты
1002

Биологи из Университета Сан-Диего (США) объявили об обнаружении ранее неизвестного вируса-бактериофага, поражающего один из самых распространенных типов кишечных бактерий. Ученые полагают, что вновь открытый вирус присутствует в кишечнике у более чем половины населения Земли и может играть важную роль в развитии ожирения и диабета. 24 июля работа опубликована в онлайн-версии журнала Nature Communications.

Специалист по биоинформатике Роберт Эдвардс (Robert A. Edwards) и его коллеги выявили фрагменты ранее неизвестной вирусной ДНК длиной примерно 97 тысяч пар оснований. Это произошло в ходе компьютерного анализа результатов предыдущих исследований обитающих в кишечной микрофлоре вирусов. Фрагменты были обнаружены в фекальных образцах двенадцати не связанных между собой человек. Проведенная затем проверка по базам данных консорциума «Микробиом человека» и  MG-RAST (веб-сервер автоматического метагеномного анализа) показала присутствие ДНК нового вируса в большом числе образцов человеческой кишечной микробиоты.

Для подтверждения существования вируса, названного первооткрывателями crAssphage, в реальности авторы применили метод амплификации ДНК (искусственного увеличения числа копий последовательности ДНК). Они выявили его присутствие в исходном биоматериале, использованном при создании базы данных консорциума «Микробиом человека». «У нас есть биологическое доказательство того, что вирус, который мы изначально нашли с помощью компьютера, действительно существует», – отметил один из членов группы, вирусолог Джон Мокили (John Mokili). 

Опираясь на аналогии в белковом составе ДНК crAssphage с уже описанными вирусами, Эдвардс и его коллеги пришли к выводу, что открытый ими микроорганизм является бактериофагом (вирусом, избирательно поражающим бактериальные клетки и вызывающим их разрушение). Используя современные биоинформационные технологии, ученые установили, что мишенью crAssphage является Bacteriodetes – один из самых распространенных типов кишечных бактерий. Эти бактерии обитают в прямой кишке и, как считается, играют ключевую роль в биологическом механизме, связывающем развитие ожирения и диабета с составом кишечной микрофлоры. Каким образом влияет на этот процесс crAssphage, еще предстоит выяснить, отмечают авторы.    

Широкая распространенность вновь открытого вируса среди населения планеты – в шесть раз превышающая таковую у других бактериофагов – свидетельствует о его древности, однако тот факт, что он до сих пор «проходил под радарами», довольно странен, считает Эдвардс.

Стоит отметить, что в последние годы появилось много научных данных, предполагающих ключевую роль состава кишечной микрофлоры в патогенезе различных заболеваний. Помимо ожирения и диабета, речь идет о болезни Крона, аутизмеревматоидном артритерассеянном склерозе. В начале июля биологи из Технического университета Дании сообщили о выявлении в человеческом кишечном микробиоме свыше полутысячи ранее неизвестных бактерий, а также около 800 новых бактериофагов.

 

Клещевые инфекции — чем опасен анаплазмоз? Объясняет врач Врачи говорят Клещевые инфекции — чем опасен анаплазмоз? Объясняет врач
Инфекция может стать эндемичной для Центрального федерального округа
Что может сделать борщевик человеку? Объясняем по науке Как правильно Что может сделать борщевик человеку? Объясняем по науке
Опасное растение, вызывающее ожоги и аллергию